Skip to main content
Ctrl+K
logo

Lamin Docs

Site Navigation

  • Guide
  • Reference
  • Changelog

Site Navigation

  • Guide
  • Reference
  • Changelog
  • lamindb.File
  • lamindb.Folder
  • lamindb.Run
  • lamindb.Transform
  • lamindb.Features
  • lamindb.select
  • lamindb.add
  • lamindb.parse
  • lamindb.delete
  • lamindb.Session
  • lamindb.track
  • lamindb.view
  • lamindb.User
  • lamindb.Project
  • lamindb.Storage
  • lamindb.schema
    • lamindb.schema.graph
    • lamindb.schema.view
    • lamindb.schema.dev
      • lamindb.schema.dev.version_yvzi
      • lamindb.schema.dev.migration_yvzi
      • lamindb.schema.dev.id
        • lamindb.schema.dev.id.base26
        • lamindb.schema.dev.id.base62
        • lamindb.schema.dev.id.base64
        • lamindb.schema.dev.id.schema
        • lamindb.schema.dev.id.user
        • lamindb.schema.dev.id.instance
        • lamindb.schema.dev.id.storage
        • lamindb.schema.dev.id.file
        • lamindb.schema.dev.id.folder
        • lamindb.schema.dev.id.run
        • lamindb.schema.dev.id.transform
        • lamindb.schema.dev.id.project
        • lamindb.schema.dev.id.secret
      • lamindb.schema.dev.sqlmodel
        • lamindb.schema.dev.sqlmodel.BaseORM
  • lamindb.setup
    • lamindb.setup.signup
    • lamindb.setup.login
    • lamindb.setup.init
    • lamindb.setup.load
    • lamindb.setup.close
    • lamindb.setup.delete
    • lamindb.setup.info
    • lamindb.setup.set
    • lamindb.setup.register
    • lamindb.setup.migrate
    • lamindb.setup.settings
    • lamindb.setup.dev
      • lamindb.setup.dev.upath
        • lamindb.setup.dev.upath.UPath
        • lamindb.setup.dev.upath.infer_filesystem
      • lamindb.setup.dev.UserSettings
      • lamindb.setup.dev.InstanceSettings
      • lamindb.setup.dev.StorageSettings
  • lamindb.link
    • lamindb.link.RunInput
    • lamindb.link.FileFeatures
    • lamindb.link.ProjectFolder
    • lamindb.link.FolderFile
  • lamindb.context
  • lamindb.settings
  • lamindb.types
    • lamindb.types.PathLike
    • lamindb.types.DataLike
    • lamindb.types.ListLike
    • lamindb.types.SQLModelField
    • lamindb.types.TransformType
  • lamindb.dev
    • lamindb.dev.db
      • lamindb.dev.db.SelectStmt
      • lamindb.dev.db.ExecStmt
    • lamindb.dev.LazyDataFrame
    • lamindb.dev.datasets
      • lamindb.dev.datasets.file_fcs
      • lamindb.dev.datasets.file_jpg_paradisi05
      • lamindb.dev.datasets.file_fastq
      • lamindb.dev.datasets.file_bam
      • lamindb.dev.datasets.file_mini_csv
      • lamindb.dev.datasets.dir_scrnaseq_cellranger
      • lamindb.dev.datasets.generate_cell_ranger_files
      • lamindb.dev.datasets.df_iris
      • lamindb.dev.datasets.anndata_mouse_sc_lymph_node
      • lamindb.dev.datasets.anndata_human_immune_cells
      • lamindb.dev.datasets.anndata_pbmc68k_reduced
      • lamindb.dev.datasets.anndata_pbmc3k_processed
      • lamindb.dev.datasets.anndata_with_obs
    • lamindb.dev.doc_args

lamindb.dev.datasets.anndata_mouse_sc_lymph_node#

lamindb.dev.datasets.anndata_mouse_sc_lymph_node()#

Mouse lymph node scRNA-seq dataset from EBI.

Subsampled to 10k genes.

From: https://www.ebi.ac.uk/arrayexpress/experiments/E-MTAB-8414/

Return type:

AnnData

previous

lamindb.dev.datasets.df_iris

next

lamindb.dev.datasets.anndata_human_immune_cells

  • anndata_mouse_sc_lymph_node()
Documentation
  • LaminDB
  • Bionty
  • nbproject
Social
  • Twitter
  • GitHub
  • LinkedIn
Made with 🤔 & ❤️ worldwide, HQ Munich.
© 2023 Lamin Labs · Imprint · Contact